Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FAM228BP0C875 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM228BP0C875 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM228BP0C875 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms