Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L7P0C7H9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L7P0C7H9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms