Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMBSP08397 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMBSP08397 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMBSP08397 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HMBSP08397 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMBSP08397 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMBSP08397 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HMBSP08397 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMBSP08397 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMBSP08397 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMBSP08397 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HMBSP08397 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMBSP08397 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMBSP08397 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HMBSP08397 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMBSP08397 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMBSP08397 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMBSP08397 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMBSP08397 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HMBSP08397 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMBSP08397 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMBSP08397 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMBSP08397 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMBSP08397 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMBSP08397 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMBSP08397 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMBSP08397 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMBSP08397 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMBSP08397 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMBSP08397 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMBSP08397 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMBSP08397 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMBSP08397 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HMBSP08397 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HMBSP08397 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMBSP08397 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMBSP08397 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HMBSP08397 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMBSP08397 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
HMBSP08397 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMBSP08397 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMBSP08397 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMBSP08397 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HMBSP08397 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMBSP08397 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMBSP08397 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMBSP08397 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMBSP08397 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMBSP08397 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMBSP08397 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMBSP08397 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMBSP08397 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMBSP08397 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMBSP08397 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMBSP08397 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMBSP08397 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMBSP08397 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMBSP08397 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HMBSP08397 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMBSP08397 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMBSP08397 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMBSP08397 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMBSP08397 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMBSP08397 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMBSP08397 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMBSP08397 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMBSP08397 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMBSP08397 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMBSP08397 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMBSP08397 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMBSP08397 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HMBSP08397 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMBSP08397 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMBSP08397 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMBSP08397 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMBSP08397 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMBSP08397 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMBSP08397 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMBSP08397 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMBSP08397 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HMBSP08397 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMBSP08397 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMBSP08397 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMBSP08397 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMBSP08397 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMBSP08397 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMBSP08397 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HMBSP08397 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HMBSP08397 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMBSP08397 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HMBSP08397 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMBSP08397 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMBSP08397 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMBSP08397 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMBSP08397 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMBSP08397 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMBSP08397 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HMBSP08397 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HMBSP08397 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMBSP08397 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms