Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HSP90AB1P08238 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HSP90AB1P08238 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HSP90AB1P08238 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms