Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1RP00736 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1RP00736 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1RP00736 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1RP00736 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
C1RP00736 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1RP00736 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1RP00736 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1RP00736 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1RP00736 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1RP00736 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1RP00736 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1RP00736 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1RP00736 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1RP00736 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1RP00736 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1RP00736 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C1RP00736 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1RP00736 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1RP00736 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1RP00736 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1RP00736 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1RP00736 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1RP00736 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1RP00736 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1RP00736 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1RP00736 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1RP00736 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
C1RP00736 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
C1RP00736 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1RP00736 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1RP00736 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1RP00736 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1RP00736 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C1RP00736 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1RP00736 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1RP00736 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1RP00736 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1RP00736 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1RP00736 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1RP00736 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1RP00736 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1RP00736 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1RP00736 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1RP00736 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1RP00736 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1RP00736 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1RP00736 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C1RP00736 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1RP00736 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1RP00736 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1RP00736 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1RP00736 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1RP00736 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
C1RP00736 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C1RP00736 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1RP00736 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C1RP00736 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
C1RP00736 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C1RP00736 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C1RP00736 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1RP00736 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1RP00736 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1RP00736 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1RP00736 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1RP00736 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1RP00736 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1RP00736 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1RP00736 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1RP00736 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1RP00736 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1RP00736 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1RP00736 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1RP00736 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1RP00736 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1RP00736 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1RP00736 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1RP00736 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1RP00736 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1RP00736 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1RP00736 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1RP00736 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C1RP00736 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1RP00736 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
C1RP00736 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1RP00736 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1RP00736 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1RP00736 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1RP00736 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1RP00736 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1RP00736 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1RP00736 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1RP00736 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1RP00736 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1RP00736 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1RP00736 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1RP00736 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1RP00736 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
C1RP00736 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1RP00736 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms