Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1O95476 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1O95476 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTDNEP1O95476 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 795.1 ms