Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.1 ms