Protein–RNA interactions for Protein: O95178

NDUFB2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB2O95178 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFB2O95178 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB2O95178 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFB2O95178 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms