Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIOO75962 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIOO75962 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIOO75962 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIOO75962 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIOO75962 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIOO75962 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIOO75962 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIOO75962 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIOO75962 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIOO75962 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIOO75962 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIOO75962 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIOO75962 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIOO75962 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIOO75962 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIOO75962 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIOO75962 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIOO75962 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIOO75962 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIOO75962 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIOO75962 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIOO75962 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIOO75962 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIOO75962 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIOO75962 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIOO75962 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIOO75962 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIOO75962 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIOO75962 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIOO75962 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIOO75962 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIOO75962 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIOO75962 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIOO75962 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIOO75962 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIOO75962 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIOO75962 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIOO75962 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIOO75962 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIOO75962 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIOO75962 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIOO75962 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIOO75962 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIOO75962 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIOO75962 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIOO75962 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIOO75962 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIOO75962 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIOO75962 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIOO75962 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIOO75962 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIOO75962 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIOO75962 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIOO75962 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIOO75962 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIOO75962 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIOO75962 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIOO75962 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIOO75962 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIOO75962 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIOO75962 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIOO75962 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIOO75962 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIOO75962 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIOO75962 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIOO75962 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIOO75962 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIOO75962 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIOO75962 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIOO75962 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIOO75962 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIOO75962 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIOO75962 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIOO75962 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIOO75962 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIOO75962 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIOO75962 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIOO75962 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIOO75962 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIOO75962 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIOO75962 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIOO75962 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIOO75962 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIOO75962 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIOO75962 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIOO75962 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIOO75962 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIOO75962 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIOO75962 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIOO75962 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIOO75962 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIOO75962 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIOO75962 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIOO75962 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOO75962 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOO75962 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOO75962 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOO75962 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIOO75962 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms