Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OFD1O75665 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OFD1O75665 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OFD1O75665 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
OFD1O75665 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
OFD1O75665 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
OFD1O75665 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
OFD1O75665 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OFD1O75665 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
OFD1O75665 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OFD1O75665 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OFD1O75665 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
OFD1O75665 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OFD1O75665 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OFD1O75665 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OFD1O75665 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OFD1O75665 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OFD1O75665 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OFD1O75665 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OFD1O75665 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OFD1O75665 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OFD1O75665 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
OFD1O75665 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OFD1O75665 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OFD1O75665 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OFD1O75665 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OFD1O75665 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OFD1O75665 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OFD1O75665 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OFD1O75665 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OFD1O75665 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OFD1O75665 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
OFD1O75665 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OFD1O75665 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OFD1O75665 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
OFD1O75665 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
OFD1O75665 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
OFD1O75665 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
OFD1O75665 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
OFD1O75665 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OFD1O75665 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
OFD1O75665 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
OFD1O75665 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
OFD1O75665 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
OFD1O75665 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
OFD1O75665 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
OFD1O75665 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OFD1O75665 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OFD1O75665 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
OFD1O75665 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OFD1O75665 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OFD1O75665 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OFD1O75665 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
OFD1O75665 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OFD1O75665 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OFD1O75665 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OFD1O75665 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OFD1O75665 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OFD1O75665 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OFD1O75665 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
OFD1O75665 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OFD1O75665 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OFD1O75665 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OFD1O75665 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OFD1O75665 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OFD1O75665 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OFD1O75665 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OFD1O75665 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
OFD1O75665 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OFD1O75665 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
OFD1O75665 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
OFD1O75665 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
OFD1O75665 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
OFD1O75665 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
OFD1O75665 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
OFD1O75665 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
OFD1O75665 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
OFD1O75665 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
OFD1O75665 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OFD1O75665 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OFD1O75665 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OFD1O75665 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OFD1O75665 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
OFD1O75665 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OFD1O75665 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
OFD1O75665 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OFD1O75665 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OFD1O75665 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OFD1O75665 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OFD1O75665 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
OFD1O75665 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OFD1O75665 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
OFD1O75665 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OFD1O75665 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OFD1O75665 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OFD1O75665 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OFD1O75665 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OFD1O75665 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OFD1O75665 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OFD1O75665 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms