Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM1O75626 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM1O75626 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM1O75626 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM1O75626 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM1O75626 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM1O75626 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM1O75626 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM1O75626 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM1O75626 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM1O75626 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM1O75626 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRDM1O75626 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms