Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSO75390 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CSO75390 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSO75390 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CSO75390 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSO75390 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSO75390 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSO75390 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSO75390 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSO75390 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSO75390 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSO75390 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSO75390 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSO75390 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CSO75390 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSO75390 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSO75390 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSO75390 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSO75390 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSO75390 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSO75390 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSO75390 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSO75390 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CSO75390 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSO75390 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSO75390 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSO75390 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSO75390 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSO75390 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSO75390 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSO75390 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSO75390 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSO75390 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CSO75390 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSO75390 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSO75390 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSO75390 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSO75390 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSO75390 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSO75390 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSO75390 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSO75390 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSO75390 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSO75390 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSO75390 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSO75390 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSO75390 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSO75390 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CSO75390 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSO75390 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSO75390 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSO75390 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSO75390 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSO75390 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSO75390 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSO75390 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSO75390 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSO75390 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSO75390 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSO75390 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSO75390 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSO75390 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CSO75390 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CSO75390 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSO75390 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSO75390 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSO75390 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSO75390 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSO75390 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSO75390 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSO75390 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSO75390 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSO75390 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSO75390 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSO75390 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSO75390 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSO75390 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSO75390 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSO75390 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSO75390 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSO75390 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSO75390 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSO75390 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSO75390 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSO75390 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSO75390 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSO75390 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CSO75390 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSO75390 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSO75390 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSO75390 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSO75390 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSO75390 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSO75390 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSO75390 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSO75390 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSO75390 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSO75390 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CSO75390 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSO75390 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms