Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP3O75386 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP3O75386 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP3O75386 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP3O75386 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP3O75386 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP3O75386 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP3O75386 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP3O75386 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP3O75386 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP3O75386 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP3O75386 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP3O75386 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP3O75386 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP3O75386 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP3O75386 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TULP3O75386 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TULP3O75386 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP3O75386 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP3O75386 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP3O75386 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP3O75386 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP3O75386 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP3O75386 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP3O75386 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP3O75386 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP3O75386 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP3O75386 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP3O75386 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP3O75386 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP3O75386 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TULP3O75386 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TULP3O75386 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP3O75386 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP3O75386 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP3O75386 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP3O75386 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP3O75386 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TULP3O75386 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TULP3O75386 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TULP3O75386 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TULP3O75386 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TULP3O75386 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TULP3O75386 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP3O75386 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP3O75386 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP3O75386 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP3O75386 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP3O75386 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP3O75386 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TULP3O75386 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP3O75386 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP3O75386 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP3O75386 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP3O75386 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP3O75386 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP3O75386 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP3O75386 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP3O75386 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP3O75386 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP3O75386 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP3O75386 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP3O75386 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP3O75386 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TULP3O75386 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TULP3O75386 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TULP3O75386 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TULP3O75386 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TULP3O75386 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP3O75386 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP3O75386 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP3O75386 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP3O75386 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TULP3O75386 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP3O75386 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP3O75386 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TULP3O75386 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP3O75386 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP3O75386 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP3O75386 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP3O75386 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP3O75386 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP3O75386 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TULP3O75386 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP3O75386 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP3O75386 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TULP3O75386 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TULP3O75386 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TULP3O75386 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TULP3O75386 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TULP3O75386 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TULP3O75386 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TULP3O75386 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TULP3O75386 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TULP3O75386 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TULP3O75386 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TULP3O75386 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TULP3O75386 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TULP3O75386 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TULP3O75386 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms