Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GADD45BO75293 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GADD45BO75293 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GADD45BO75293 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GADD45BO75293 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms