Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC22O60826 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC22O60826 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC22O60826 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms