Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCMT2O60294 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms