Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDIL3O43854 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EDIL3O43854 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDIL3O43854 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDIL3O43854 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDIL3O43854 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms