Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUX1O43812 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUX1O43812 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUX1O43812 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUX1O43812 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUX1O43812 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUX1O43812 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUX1O43812 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUX1O43812 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUX1O43812 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUX1O43812 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUX1O43812 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUX1O43812 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUX1O43812 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUX1O43812 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUX1O43812 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUX1O43812 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUX1O43812 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUX1O43812 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUX1O43812 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUX1O43812 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUX1O43812 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUX1O43812 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUX1O43812 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUX1O43812 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUX1O43812 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUX1O43812 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUX1O43812 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUX1O43812 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUX1O43812 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUX1O43812 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUX1O43812 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUX1O43812 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUX1O43812 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUX1O43812 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUX1O43812 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DUX1O43812 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUX1O43812 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUX1O43812 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DUX1O43812 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DUX1O43812 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DUX1O43812 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUX1O43812 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUX1O43812 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DUX1O43812 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DUX1O43812 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUX1O43812 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUX1O43812 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUX1O43812 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUX1O43812 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUX1O43812 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUX1O43812 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUX1O43812 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUX1O43812 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUX1O43812 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUX1O43812 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUX1O43812 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUX1O43812 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUX1O43812 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUX1O43812 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUX1O43812 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUX1O43812 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUX1O43812 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUX1O43812 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DUX1O43812 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUX1O43812 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUX1O43812 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUX1O43812 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUX1O43812 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUX1O43812 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUX1O43812 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DUX1O43812 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUX1O43812 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUX1O43812 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DUX1O43812 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUX1O43812 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUX1O43812 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUX1O43812 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUX1O43812 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUX1O43812 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUX1O43812 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUX1O43812 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DUX1O43812 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUX1O43812 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUX1O43812 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUX1O43812 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUX1O43812 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUX1O43812 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUX1O43812 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUX1O43812 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUX1O43812 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUX1O43812 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUX1O43812 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUX1O43812 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUX1O43812 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUX1O43812 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUX1O43812 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUX1O43812 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUX1O43812 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUX1O43812 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms