Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
APAF1O14727 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
APAF1O14727 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
APAF1O14727 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
APAF1O14727 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
APAF1O14727 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
APAF1O14727 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
APAF1O14727 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
APAF1O14727 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
APAF1O14727 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
APAF1O14727 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
APAF1O14727 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
APAF1O14727 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
APAF1O14727 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
APAF1O14727 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
APAF1O14727 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
APAF1O14727 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
APAF1O14727 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
APAF1O14727 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
APAF1O14727 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
APAF1O14727 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
APAF1O14727 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
APAF1O14727 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
APAF1O14727 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
APAF1O14727 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
APAF1O14727 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
APAF1O14727 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
APAF1O14727 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
APAF1O14727 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
APAF1O14727 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
APAF1O14727 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
APAF1O14727 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
APAF1O14727 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
APAF1O14727 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
APAF1O14727 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
APAF1O14727 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
APAF1O14727 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
APAF1O14727 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
APAF1O14727 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
APAF1O14727 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
APAF1O14727 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
APAF1O14727 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
APAF1O14727 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
APAF1O14727 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
APAF1O14727 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
APAF1O14727 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
APAF1O14727 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
APAF1O14727 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
APAF1O14727 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
APAF1O14727 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
APAF1O14727 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
APAF1O14727 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
APAF1O14727 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
APAF1O14727 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
APAF1O14727 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
APAF1O14727 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
APAF1O14727 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
APAF1O14727 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
APAF1O14727 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
APAF1O14727 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
APAF1O14727 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
APAF1O14727 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
APAF1O14727 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
APAF1O14727 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
APAF1O14727 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
APAF1O14727 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
APAF1O14727 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
APAF1O14727 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
APAF1O14727 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
APAF1O14727 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
APAF1O14727 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
APAF1O14727 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
APAF1O14727 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
APAF1O14727 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
APAF1O14727 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
APAF1O14727 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
APAF1O14727 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
APAF1O14727 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
APAF1O14727 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
APAF1O14727 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
APAF1O14727 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
APAF1O14727 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
APAF1O14727 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.77
APAF1O14727 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
APAF1O14727 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
APAF1O14727 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
APAF1O14727 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
APAF1O14727 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
APAF1O14727 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
APAF1O14727 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
APAF1O14727 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
APAF1O14727 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
APAF1O14727 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
APAF1O14727 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
APAF1O14727 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
APAF1O14727 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
APAF1O14727 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
APAF1O14727 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
APAF1O14727 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
APAF1O14727 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms