Protein–RNA interactions for Protein: H3BV60

TGFBR3L, Transforming growth factor-beta receptor type 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3LH3BV60 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFBR3LH3BV60 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR3LH3BV60 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGFBR3LH3BV60 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms