Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BHMG1C9JSJ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BHMG1C9JSJ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms