Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4orf47A7E2U8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C4orf47A7E2U8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4orf47A7E2U8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms