Protein–RNA interactions for Protein: A6NN73

GOLGA8CP, Golgin subfamily A member 8C, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8CPA6NN73 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8CPA6NN73 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8CPA6NN73 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8CPA6NN73 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8CPA6NN73 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8CPA6NN73 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8CPA6NN73 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8CPA6NN73 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8CPA6NN73 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8CPA6NN73 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8CPA6NN73 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8CPA6NN73 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8CPA6NN73 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8CPA6NN73 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8CPA6NN73 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8CPA6NN73 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8CPA6NN73 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA8CPA6NN73 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA8CPA6NN73 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA8CPA6NN73 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA8CPA6NN73 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA8CPA6NN73 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA8CPA6NN73 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA8CPA6NN73 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA8CPA6NN73 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA8CPA6NN73 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA8CPA6NN73 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA8CPA6NN73 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8CPA6NN73 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8CPA6NN73 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8CPA6NN73 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8CPA6NN73 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8CPA6NN73 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms