Protein–RNA interactions for Protein: A6NM11

LRRC37A2, Leucine-rich repeat-containing protein 37A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC37A2A6NM11 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC37A2A6NM11 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC37A2A6NM11 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC37A2A6NM11 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms