Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL33A6NCF5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL33A6NCF5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL33A6NCF5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms