Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRBA1A5PL33 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRBA1A5PL33 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRBA1A5PL33 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KRBA1A5PL33 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms