Protein–RNA interactions for Protein: A2PYH4

HFM1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFM1A2PYH4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
HFM1A2PYH4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
HFM1A2PYH4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
HFM1A2PYH4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
HFM1A2PYH4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
HFM1A2PYH4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
HFM1A2PYH4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
HFM1A2PYH4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
HFM1A2PYH4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
HFM1A2PYH4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
HFM1A2PYH4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
HFM1A2PYH4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HFM1A2PYH4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
HFM1A2PYH4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
HFM1A2PYH4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
HFM1A2PYH4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
HFM1A2PYH4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
HFM1A2PYH4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
HFM1A2PYH4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
HFM1A2PYH4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
HFM1A2PYH4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
HFM1A2PYH4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
HFM1A2PYH4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
HFM1A2PYH4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
HFM1A2PYH4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
HFM1A2PYH4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms