Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A1B0GTW7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A1B0GTW7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
A0A1B0GTW7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1B0GTW7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1B0GTW7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1B0GTW7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1B0GTW7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1B0GTW7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GTW7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GTW7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1B0GTW7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1B0GTW7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms