Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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