Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WV62

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WV62 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A087WV62 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WV62 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WV62 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WV62 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WV62 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WV62 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WV62 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WV62 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WV62 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WV62 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A087WV62 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A087WV62 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A087WV62 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A087WV62 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A087WV62 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A087WV62 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A087WV62 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087WV62 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087WV62 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087WV62 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087WV62 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087WV62 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087WV62 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087WV62 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087WV62 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087WV62 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087WV62 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087WV62 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087WV62 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087WV62 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WV62 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WV62 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WV62 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WV62 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WV62 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WV62 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WV62 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WV62 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WV62 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WV62 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WV62 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WV62 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WV62 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WV62 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WV62 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WV62 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WV62 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WV62 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WV62 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WV62 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WV62 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WV62 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WV62 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WV62 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A087WV62 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A087WV62 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A087WV62 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WV62 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WV62 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WV62 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WV62 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WV62 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WV62 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WV62 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WV62 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WV62 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WV62 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WV62 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WV62 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WV62 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WV62 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WV62 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WV62 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WV62 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WV62 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WV62 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WV62 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WV62 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WV62 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WV62 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WV62 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WV62 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WV62 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WV62 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WV62 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WV62 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WV62 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WV62 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WV62 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WV62 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WV62 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WV62 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WV62 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WV62 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WV62 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WV62 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WV62 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WV62 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WV62 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms