Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
R4GMQ9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
R4GMQ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
R4GMQ9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
R4GMQ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
R4GMQ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
R4GMQ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
R4GMQ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
R4GMQ9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
R4GMQ9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
R4GMQ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R4GMQ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R4GMQ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R4GMQ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R4GMQ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
R4GMQ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
R4GMQ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R4GMQ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R4GMQ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R4GMQ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R4GMQ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R4GMQ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R4GMQ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R4GMQ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
R4GMQ9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R4GMQ9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R4GMQ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
R4GMQ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
R4GMQ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R4GMQ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
R4GMQ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
R4GMQ9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
R4GMQ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
R4GMQ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
R4GMQ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R4GMQ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R4GMQ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R4GMQ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
R4GMQ9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R4GMQ9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
R4GMQ9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
R4GMQ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
R4GMQ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R4GMQ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R4GMQ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R4GMQ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R4GMQ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
R4GMQ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
R4GMQ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
R4GMQ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
R4GMQ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
R4GMQ9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
R4GMQ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
R4GMQ9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
R4GMQ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
R4GMQ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
R4GMQ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
R4GMQ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
R4GMQ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
R4GMQ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
R4GMQ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
R4GMQ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
R4GMQ9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
R4GMQ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
R4GMQ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R4GMQ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R4GMQ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R4GMQ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R4GMQ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R4GMQ9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R4GMQ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
R4GMQ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
R4GMQ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R4GMQ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
R4GMQ9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
R4GMQ9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R4GMQ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
R4GMQ9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R4GMQ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
R4GMQ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
R4GMQ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R4GMQ9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
R4GMQ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R4GMQ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R4GMQ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R4GMQ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R4GMQ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R4GMQ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R4GMQ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R4GMQ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R4GMQ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
R4GMQ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R4GMQ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R4GMQ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R4GMQ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R4GMQ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R4GMQ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R4GMQ9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R4GMQ9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R4GMQ9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms