Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHLDA3Q9Y5J5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms