Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCDHB12Q9Y5F1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHB12Q9Y5F1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHB12Q9Y5F1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms