Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC42Q9Y546 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC42Q9Y546 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC42Q9Y546 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms