Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KNSTRNQ9Y448 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
KNSTRNQ9Y448 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.8■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.78■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
KNSTRNQ9Y448 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KNSTRNQ9Y448 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
KNSTRNQ9Y448 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KNSTRNQ9Y448 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KNSTRNQ9Y448 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KNSTRNQ9Y448 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
KNSTRNQ9Y448 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KNSTRNQ9Y448 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KNSTRNQ9Y448 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KNSTRNQ9Y448 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KNSTRNQ9Y448 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KNSTRNQ9Y448 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KNSTRNQ9Y448 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KNSTRNQ9Y448 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms