Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A1Q9Y2Q0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms