Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
USP20Q9Y2K6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP20Q9Y2K6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP20Q9Y2K6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP20Q9Y2K6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms