Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP11BQ9Y2G3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP11BQ9Y2G3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP11BQ9Y2G3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms