Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NOD1Q9Y239 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOD1Q9Y239 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOD1Q9Y239 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms