Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN7

PPP6R1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6R1Q9UPN7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PPP6R1Q9UPN7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PPP6R1Q9UPN7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPP6R1Q9UPN7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPP6R1Q9UPN7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PPP6R1Q9UPN7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PPP6R1Q9UPN7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PPP6R1Q9UPN7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PPP6R1Q9UPN7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
PPP6R1Q9UPN7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PPP6R1Q9UPN7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PPP6R1Q9UPN7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PPP6R1Q9UPN7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PPP6R1Q9UPN7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PPP6R1Q9UPN7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PPP6R1Q9UPN7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PPP6R1Q9UPN7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPP6R1Q9UPN7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPP6R1Q9UPN7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPP6R1Q9UPN7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PPP6R1Q9UPN7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PPP6R1Q9UPN7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPP6R1Q9UPN7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPP6R1Q9UPN7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPP6R1Q9UPN7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms