Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV8

CBLC, E3 ubiquitin-protein ligase CBL-C, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLCQ9ULV8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBLCQ9ULV8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLCQ9ULV8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBLCQ9ULV8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBLCQ9ULV8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBLCQ9ULV8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBLCQ9ULV8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBLCQ9ULV8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBLCQ9ULV8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBLCQ9ULV8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBLCQ9ULV8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBLCQ9ULV8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms