Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPUSD1Q9UJJ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPUSD1Q9UJJ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPUSD1Q9UJJ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms