Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM8Q9UJA3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM8Q9UJA3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM8Q9UJA3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.7 ms