Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MSRAQ9UJ68 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MSRAQ9UJ68 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSRAQ9UJ68 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSRAQ9UJ68 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSRAQ9UJ68 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSRAQ9UJ68 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSRAQ9UJ68 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSRAQ9UJ68 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSRAQ9UJ68 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSRAQ9UJ68 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSRAQ9UJ68 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSRAQ9UJ68 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSRAQ9UJ68 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSRAQ9UJ68 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSRAQ9UJ68 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSRAQ9UJ68 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MSRAQ9UJ68 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSRAQ9UJ68 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms