Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHORDC1Q9UHD1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHORDC1Q9UHD1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms