Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEPT3Q9UH03 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEPT3Q9UH03 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEPT3Q9UH03 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEPT3Q9UH03 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT3Q9UH03 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT3Q9UH03 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT3Q9UH03 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT3Q9UH03 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT3Q9UH03 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT3Q9UH03 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEPT3Q9UH03 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEPT3Q9UH03 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEPT3Q9UH03 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEPT3Q9UH03 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms