Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLN8Q9UBY8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLN8Q9UBY8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms