Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNG4Q9UBN1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNG4Q9UBN1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms