Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEMTQ9UBM1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEMTQ9UBM1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEMTQ9UBM1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEMTQ9UBM1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEMTQ9UBM1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEMTQ9UBM1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEMTQ9UBM1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEMTQ9UBM1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEMTQ9UBM1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEMTQ9UBM1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEMTQ9UBM1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEMTQ9UBM1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PEMTQ9UBM1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEMTQ9UBM1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PEMTQ9UBM1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PEMTQ9UBM1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PEMTQ9UBM1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEMTQ9UBM1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEMTQ9UBM1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEMTQ9UBM1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEMTQ9UBM1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEMTQ9UBM1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PEMTQ9UBM1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEMTQ9UBM1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEMTQ9UBM1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEMTQ9UBM1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEMTQ9UBM1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEMTQ9UBM1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEMTQ9UBM1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEMTQ9UBM1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms