Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDP2Q9P2J9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDP2Q9P2J9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms